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<title>Primer</title>

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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">Primer</span></h1>

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<p>Als <b>Primer</b> (Pl.: die Primer; <a href="Internationales_Phonetisches_Alphabet" title="Internationales Phonetisches Alphabet">IPA</a>: [<style data-mw-deduplicate="TemplateStyles:r227981795">

/* start https://de.wikipedia.org/ */

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</style><span class="navigation-not-searchable"><span class="IPA"><a href="Liste_der_IPA-Zeichen" title="Liste der IPA-Zeichen"><span title="Aussprache im Internationalen Phonetischen Alphabet (IPA)" lang="zxx">ˊpʁaɪ̯mɐ</span></a></span></span>]) wird in der <a href="Molekularbiologie" title="Molekularbiologie">Molekularbiologie</a> ein <a href="Oligonukleotid" class="mw-redirect" title="Oligonukleotid">Oligonukleotid</a> bezeichnet, das als Startpunkt für DNA-<a href="Replikation" title="Replikation">replizierende</a> <a href="Enzym" title="Enzym">Enzyme</a> wie die <a href="DNA-Polymerase" class="mw-redirect" title="DNA-Polymerase">DNA-Polymerase</a> dient.

</p><p>DNA-Polymerasen benötigen eine <a href="Hydroxygruppe" title="Hydroxygruppe">Hydroxygruppe</a> als Startpunkt für ihre erste Verknüpfungsreaktion. Primer stellen mit ihrem 3'-OH-Ende eine passende Hydroxyfunktion zur Verfügung. Primer können sowohl aus <a href="Desoxyribonukleins%C3%A4ure" title="Desoxyribonukleinsäure">DNA</a> als auch aus <a href="Ribonukleins%C3%A4ure" title="Ribonukleinsäure">RNA</a> bestehen. Bei der <a href="Replikation" title="Replikation">Replikation</a> dient in <a href="Prokaryoten" title="Prokaryoten">Prokaryoten</a> und <a href="Eukaryoten" title="Eukaryoten">Eukaryoten</a> RNA als Primermaterial. In Prokaryoten synthetisiert die <a href="Primase" title="Primase">Primase</a>, auch als DnaG-Protein bezeichnet, die Primersequenzen. In Eukaryoten besitzt die DNA-Polymerase α eine Primasefunktion. Einen Sonderfall stellt die DNA-Synthese an den <a href="Telomer" title="Telomer">Telomeren</a> eukaryotischer Zellen dar. Hier dient dem polymerisierenden Enzym <a href="Telomerase" title="Telomerase">Telomerase</a> das 3'-OH-Ende der DNA als Primersequenz. Bei Prokaryoten werden die bei der Replikation auftauchenden Primer durch 5'-3'-<a href="Exonuklease" title="Exonuklease">Exonukleaseaktivität</a> der Polymerase I oder durch die <a href="Ribonuklease" class="mw-redirect" title="Ribonuklease">RNase H</a> entfernt. In eukaryotischen Zellen werden die Primer durch verdrängende DNA-Synthese der Polymerase δ und Restriktion durch die <a href="Endonuklease" title="Endonuklease">Flap-Endonuklease</a> entfernt. <a href="Allelspezifisches_Oligonukleotid" title="Allelspezifisches Oligonukleotid">Allelspezifische Oligonukleotide</a> binden an bestimmte <a href="Einzelnukleotid-Polymorphismus" title="Einzelnukleotid-Polymorphismus">SNP</a>.

</p><p>Auch bei der <i><a href="In_vitro" title="In vitro">In-vitro</a></i>-<a href="Amplifikation_(Genetik)" title="Amplifikation (Genetik)">Amplifikation</a> von DNA, beispielsweise bei der <a href="Polymerase-Kettenreaktion" title="Polymerase-Kettenreaktion">Polymerase-Kettenreaktion (PCR)</a>, der <a href="DNA-Sequenzierung" title="DNA-Sequenzierung">DNA-Sequenzierung</a> oder bei der <a href="Reverse_Transkription" title="Reverse Transkription">reversen Transkription</a>, werden Primer benötigt. Hier lässt sich mit Hilfe der Primer der spezifische DNA-Abschnitt, der amplifiziert werden soll, festlegen.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Primerdesign">Primerdesign</h2></div>

<div class="hauptartikel" role="navigation"><span class="hauptartikel-pfeil" title="siehe" aria-hidden="true" role="presentation">→ </span><i><span class="hauptartikel-text">Hauptartikel</span>: <a href="Primerdesign" title="Primerdesign">Primerdesign</a></i></div>

<p>Der gezielte Entwurf von Primern wird als Primerdesign bezeichnet. Für die PCR-Methode werden Nukleotidsequenzen, die den zu amplifizierenden DNA-Abschnitt flankieren, bestimmt. Gemäß diesen Sequenzen werden nun passende Primersequenzen per <a href="Phosphoramidit-Synthese" title="Phosphoramidit-Synthese">Phosphoramidit-Synthese</a> hergestellt. Ein Primer repräsentiert hierbei jeweils den gegenläufigen Strang zu seinem „Primerpartner“. Primer für PCR-Ansätze haben in der Regel eine Länge von 18–30 Nukleotiden. Diverse Biotechnologiefirmen bieten mittlerweile maßgeschneiderte Primer für molekularbiologische Anwendungen an. Durch maßgeschneiderte <i>Mismatch primer</i> lassen sich über die PCR-Technik auch gezielt <a href="Mutation" title="Mutation">Mutationen</a> in Gene einführen, die z. B. im Austausch einer Aminosäure bestehen.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Weblinks">Weblinks</h2></div>

<ul><li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://frodo.wi.mit.edu/">Primer3 - Tool zur Primerableitung mit vielen Optimierungsmöglichkeiten (englisch)</a></li>

<li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.primerfox.com">Primerfox - kostenloses effizientes Tool zur Primerableitung (englisch)</a></li></ul></div><div><div class="zim-footer">

Dieser Artikel wurde von <a class="external text" title="Zuletzt bearbeitet am 2023-02-27" href="https://de.wikipedia.org/wiki/?title=Primer&oldid=231295233">Wikipedia</a> herausgegeben. Der Text ist unter <a class="external text" href="https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/deed.de">Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0</a> verfügbar, sofern nicht anders angegeben. Für die Mediendateien können zusätzliche Bedingungen gelten.

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